Pada suatu sore yang hujan, Detektif Cilik menyaksikan sebuah pembunuhan di seberang jalan. Terhalang oleh lalu lintas, pelaku berhasil lolos dan Conan Edogawa hanya mendapat satu petunjuk dari seorang detektif yang sekarat. Beberapa hari kemudian, detektif lain ditemukan tewas di tempat parkir, membuat polisi terguncang. Curiga bahwa pelakunya adalah salah satu dari mereka sendiri, semua orang di departemen kepolisian tanpa alibi menjadi tersangka. Namun, meskipun dalam keadaan siaga tinggi, mereka dikalahkan dan mengalami serangan lain—kali ini Ran Mouri berada di tengah baku tembak. Trauma, Ran terbangun di rumah sakit dengan amnesia retrograde, tidak mengingat apa pun tentang hidupnya. Segera setelah keluar dari rumah sakit, ia berjuang untuk mengingat masa lalunya dan semakin takut tidak akan mendapatkan kembali ingatannya sebelum menjadi sasaran pembunuh karena apa yang telah ia saksikan. Saat ia dijaga oleh teman dan keluarga, Conan harus mengumpulkan petunjuk dan menemukan siapa pembunuhnya sebelum mereka menyerang lagi.