Perbukitan yang rimbun di Pulau Koumi adalah salah satu dari sekian banyak alasan wisatawan mengunjungi pulau ini—alasan yang hanya kalah dengan keindahan terumbu karangnya dan legenda Anne Bonnie dan Mary Read. Museum yang menyimpan pedang dan pistol dari duo bajak laut pemberani itu sangat membantu pariwisata pulau kecil ini. Dalam perjalanan ke pulau tersebut, Kogorou Mouri yang terkenal ditemani oleh putrinya, Ran, sahabatnya Sonoko Suzuki, Detektif Cilik, dan Conan Edogawa. Setelah terjadi kesalahan di hotel terkait kamar mereka, kelompok tersebut bertemu dengan para pemburu harta karun dan mengenal demam harta karun di pulau itu. Dikirim untuk melakukan perburuan mereka sendiri, Detektif Cilik menjelajahi pulau; sementara di perairan yang jauh lebih berbahaya, Conan menemukan sebuah pembunuhan. Polisi, mengikuti petunjuk dari perampokan baru-baru ini, segera tiba, dan Koumi pun dilanda kekacauan. Yang terjadi selanjutnya adalah perebutan gila-gilaan tidak hanya oleh para pemburu harta karun tetapi juga penduduk Koumi untuk mengamankan harta rampasan Anne dan Mary yang telah lama hilang. Namun, sepanjang waktu itu, Conan, Kogorou, dan polisi mencari satu hal yang jauh lebih besar daripada kekayaan—keadilan.