Tiga bulan telah berlalu sejak Iori Kitahara mulai tinggal di atas Grand Blue, toko peralatan selam milik pamannya, dan bergabung dengan Klub Selam universitasnya. Bersama anggota lainnya, ia menghabiskan hari-harinya dengan minum-minum dan bersenang-senang tanpa perhitungan. Namun, ketika saudara perempuan Iori, Shiori, mendengar tentang perilakunya, ia memutuskan untuk mengambil tindakan sendiri—dan membawanya pulang untuk mengambil alih penginapan keluarga mereka. Meskipun telah berusaha sebaik mungkin, Shiori untuk sementara menyerah ketika melihat bagaimana Iori telah terikat dengan Grand Blue dan teman-temannya. Saat Iori dan anggota Klub Selam lainnya terus berpesta seolah tak ada hari esok, mereka berakhir dalam berbagai situasi lucu yang aneh, namun entah bagaimana masih berhasil mengasah keterampilan menyelam mereka!