Setelah konfrontasinya di Nether dengan adik laki-lakinya, Shou, tekad Shinra Kusakabe untuk menjadi pahlawan yang menyelamatkan nyawa dari teror api semakin kuat. Menemukan cara untuk mengubah Infernal kembali menjadi manusia, mengungkap misteri Evangelist dan Adolla Burst, serta menyelamatkan ibu dan Shou—inilah tujuan yang ada dalam benak Shinra. Namun, ia menyadari bahwa mencapai tujuan-tujuan ini tidak akan mudah, terutama dengan bahaya yang ditimbulkan oleh Evangelist. Rencana Evangelist jelas: mengumpulkan delapan pilar—individu yang memiliki Adolla Burst—dan mengorbankan mereka untuk menciptakan kembali Bencana Besar dari 250 tahun yang lalu. Setelah diungkapkan oleh Pilar Pertama bahwa kelahiran pilar baru akan segera tiba, Shinra bertekad untuk melindungi sesama pilar dari Evangelist. Dengan demikian, pertempuran sengit antara Pasukan Pemadam Kebakaran Khusus dan Evangelist pun berkobar. Bersama dengan Pasukan Pemadam Kebakaran Khusus, perjuangan Shinra berlanjut saat ia mengungkap kebenaran tentang Bencana Besar dan sifat Ledakan Adolla, serta misteri di balik pembakaran manusia.