Captain Tsubasa adalah kisah penuh semangat tentang seorang siswa sekolah dasar yang pikiran dan mimpinya hampir seluruhnya berpusat pada kecintaannya pada sepak bola. Tsubasa Oozora yang berusia 11 tahun mulai bermain sepak bola sejak usia sangat muda, dan meskipun bagi teman-temannya itu hanyalah olahraga rekreasi, baginya, itu berkembang menjadi semacam obsesi. Untuk mengejar mimpinya sebaik mungkin sesuai kemampuan sekolah dasarnya, Tsubasa pindah bersama ibunya ke kota Nankatsu, yang terkenal dengan tim sepak bola sekolah dasarnya yang luar biasa. Tetapi meskipun ia dengan mudah menjadi yang terbaik di kota asalnya, Nankatsu memiliki persaingan yang jauh lebih ketat, dan ia akan membutuhkan semua keterampilan dan bakatnya untuk menonjol di antara kerumunan baru ini. Ia tidak hanya bertemu saingan, tetapi juga teman-teman baru seperti gadis cantik Sanae Nakazawa dan penjaga gawang berbakat, Genzo Wakabayashi, yang memiliki gairah yang sama dengan Tsubasa, dan akan terbukti menjadi teman yang berharga dalam membantunya mewujudkan mimpinya. Mewakili Jepang di Piala Dunia FIFA adalah impian terbesar Tsubasa, tetapi dibutuhkan lebih dari sekadar bakat untuk mencapainya.