Yoichi Isagi hanya beberapa saat lagi akan mencetak gol yang akan membawa tim sepak bola SMA-nya ke kejuaraan nasional, tetapi keputusan sepersekian detik untuk mengoper bola kepada rekan setimnya merenggut kesempatan itu. Pahit, bingung, dan kecewa, Isagi bertanya-tanya apakah hasilnya akan berbeda jika dia tidak mengoper bola tersebut. Ketika striker muda itu kembali ke rumah, undangan dari Federasi Sepak Bola Jepang menantinya. Melalui proses pengambilan keputusan yang sewenang-wenang dan bias, Isagi adalah salah satu dari tiga ratus striker U-18 yang dipilih untuk proyek kontroversial bernama Blue Lock. Tujuan utama proyek ini adalah untuk mengubah salah satu pemain terpilih menjadi striker bintang tim nasional Jepang. Untuk menemukan peserta terbaik, setiap pemain berbakat harus bersaing dengan pemain lain melalui serangkaian kompetisi individu dan tim untuk mencapai puncak. Mengesampingkan keberatan etisnya terhadap proyek tersebut, Isagi merasa terdorong untuk berjuang menuju puncak, bahkan jika itu berarti menghancurkan impian 299 striker muda yang bercita-cita tinggi.